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small28新蟲 (著名寫手)
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[交流]
配體處理方法 已有1人參與
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請問一下，如果做auto dock vina對接，配體該如何處理，看到有文獻(xiàn)用DS軟件直接prepare處理，也有在ADT里加氫，加電荷，設(shè)置旋轉(zhuǎn)鍵的，兩種方法都分別試過，打分不一樣，如果配體是短肽，自己畫的，該用哪種比較靠譜呢，如果用DS，就是加了力場，而ADT里處理沒有加力場的吧 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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4樓2020-03-08 23:27:15
2樓2020-03-08 00:58:27
small28
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但是看了一些教程，沒有進(jìn)行能量優(yōu)化，只對小分子加電荷和設(shè)置鍵的旋轉(zhuǎn)，這樣會對結(jié)果有影響么 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2020-03-08 11:05:22
small28
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5樓2020-03-10 15:07:15
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