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Bachelor.木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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mcsqs
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有誰(shuí)知道m(xù)csqs具體怎么用么,特別是-2-3的選擇,以及最后如何選擇一個(gè)最好的結(jié)構(gòu) 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
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鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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是的,是第五列。 我忘了他在哪里說(shuō)過(guò),單看objective function = xxxx這一個(gè)數(shù)值好像是沒(méi)有什么參考價(jià)值。 一個(gè)比較的方法是,按照1st NN pair, 2nd NN pair ...這樣的順序,把第五列的值加起來(lái)。 例子: 2 2.528850 0.111111 0.111111 -0.000000 2 2.537153 0.111111 0.111111 -0.000000 2 3.582210 0.111111 0.111111 -0.000000 2 3.582210 0.111111 0.111111 -0.000000 3 2.537153 0.037037 0.037037 -0.000000 3 2.537153 0.037037 0.037037 -0.000000 這里有1st NN pair (第一第二行), 2nd NN pair (第三第四行), 1st NN triplet (第五第六行). 分別加起來(lái)。看第五列加起來(lái)的數(shù),比較齊第三列加起來(lái)的數(shù)。我看的文章都有報(bào)道這些數(shù)字,如果他們相差很遠(yuǎn),那就是一個(gè)可以接受的SQS。具體是多少的話(huà)其實(shí)還沒(méi)有標(biāo)準(zhǔn)。SQS能大就大一些,畢竟這樣更加接近ideal solution,在不犧牲太多計(jì)算時(shí)間的情況下,盡量大一些(60個(gè)以上吧)。多做幾個(gè)SQS,比較他們之間這些值,在他們之間選一個(gè)合適的。對(duì)于這些correlation function difference的值,我自己的經(jīng)驗(yàn)是correlation function difference/correlation function < 某個(gè)值。這個(gè)值在不同系統(tǒng)是不一樣的。沒(méi)有人做過(guò)這方面的研究,也只能看經(jīng)驗(yàn)。 |
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