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zengjiarui新蟲 (初入文壇)
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[求助]
誠心請教:兩株菌的16S測序結(jié)果很相似,可以算是同一株菌嗎?謝謝! 已有4人參與
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| 分離了一些腸球菌,27F和1492R引物對擴(kuò)增測序后,發(fā)現(xiàn)它們的序列信息很相似,很多只在序列的首尾部分有一些不同堿基,請教一下它們會(huì)是同一株菌嗎?非常感謝! |
金蟲 (小有名氣)

新蟲 (初入文壇)
新蟲 (初入文壇)
木蟲 (著名寫手)
新蟲 (初入文壇)
木蟲 (小有名氣)
| 將16S測序結(jié)果去掉頭尾峰值較差的堿基后,將你測得的幾株菌序列在NCBI中進(jìn)行兩兩比對,看一下相似性到底有多高,如果相似性在99%以上,那證實(shí)是同一個(gè)種。在這個(gè)前提下,如果同一個(gè)樣品、同一種培養(yǎng)基上挑取純化的菌落,基本上可以證實(shí)是同一株菌;但如果是在不同樣品、不同分離培養(yǎng)基下挑取的菌株,即使相似性是在99%以上,也只能證實(shí)是同一個(gè)種,但不能證實(shí)是同一株菌。如果想進(jìn)一步證實(shí)是否是同一株菌,就要將這幾株菌在同等條件下,一起進(jìn)行生理生化實(shí)驗(yàn),如果生理生化實(shí)驗(yàn)相同,可以證實(shí)是同一株菌。 |

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