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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 量子化學 » 量化新手直通車 » 構象搜索
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| 【懸賞金幣】回答本帖問題，作者sophie丁將贈送您 30 個金幣 | ||
sophie丁新蟲 (初入文壇)
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構象搜索 已有1人參與
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各位大神，苦于沒有GMMX軟件，請問一下除了GMMX 可采用MMFF94力場進行構象搜索外，還有哪款軟件也可進行同樣的計算？（可信度高，影響力較大的，有文獻支撐的） 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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2樓2020-07-31 12:15:17
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3樓2020-07-31 13:46:02
qinzhong6138
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灰�；页１康男”康�
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4樓2020-08-01 16:12:50
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5樓2020-08-05 14:50:51
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6樓2020-08-05 14:51:06
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送紅花一朵 |
由于本人是剛入門的小白，我想請教一下，采用MMFF94力場進行構象搜索后再采用高斯進行運算，或直接采用高斯優(yōu)化，得到的最穩(wěn)態(tài)結構有什么區(qū)別？ 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
7樓2020-08-05 14:53:45
paramecium86
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8樓2020-08-05 15:03:15
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送紅花一朵 |
好的，謝謝。了解了，謝謝！因為確實跟文獻進行了對比，直接用高斯算出來的能量確實比文獻中采用力場進行預優(yōu)化再采用高斯進行計算時能量要高的多。但是我現在采用了open babel 的MMFF94 力場進行預優(yōu)化后，分子的結構出現了變形，直接脫離了  發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
9樓2020-08-05 15:17:38
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10樓2020-09-03 21:34:02
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