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JZZ3090新蟲 (初入文壇)
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[求助]
請(qǐng)教rescue experiment 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 已有1人參與
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最近做了x基因敲除的細(xì)胞系，然后在這個(gè)細(xì)胞系中瞬時(shí)表達(dá)GFP-x基因,同時(shí)檢測(cè)某表型是否回歸正常水平，也就是rescue experiment（不知道中文叫什么，援救實(shí)驗(yàn)嗎？），現(xiàn)在在做顯著性分析，對(duì)統(tǒng)計(jì)方法產(chǎn)生了疑問。 我設(shè)計(jì)了三組實(shí)驗(yàn)并對(duì)其表型進(jìn)行了定量 1，對(duì)照組細(xì)胞（無(wú)敲除）表達(dá)GFP， 2，x基因敲除細(xì)胞系表達(dá)GFP， 3，x基因敲除細(xì)胞系表達(dá)GFP-x基因 我需要對(duì)比三組數(shù)據(jù)的表型，即，檢驗(yàn)第二組與第一組有是否顯著差異，第三組與第二組是否有顯著差異，以及第三組是否回歸到第一組的水平。 我應(yīng)該用哪種統(tǒng)計(jì)方法進(jìn)行顯著差異分析？ 是否應(yīng)該將三組數(shù)據(jù)拆成兩兩一組，分別進(jìn)行mann whitney test（數(shù)據(jù)不符合正態(tài)分布），還是應(yīng)該選擇其他檢驗(yàn)方法？ 我也考慮了kruskal-wallis test和two-way ANOVA kruskal-wallis的問題是，我的數(shù)據(jù)中，表型受兩種因素影響（細(xì)胞系和表達(dá)的基因），并非單因素分析 用two-way ANOVA的話，缺少了一組【對(duì)照組細(xì)胞表達(dá)GFP-x】的數(shù)據(jù)，無(wú)法進(jìn)行分析，而且我覺得這組數(shù)據(jù)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)論沒有影響 不知道有沒有對(duì)統(tǒng)計(jì)學(xué)比較了解的或者做過此類實(shí)驗(yàn)的人能幫忙解答一下我的問題。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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第一組和第三組比較確實(shí)不夠嚴(yán)謹(jǐn)，這個(gè)得看審稿人對(duì)于數(shù)據(jù)的嚴(yán)謹(jǐn)性要求有多嚴(yán)格了。 如果對(duì)照組是一個(gè)敲除對(duì)照會(huì)好一些，也就是說對(duì)照組也轉(zhuǎn)了Cas9和一個(gè)不能針對(duì)任何基因的sgRNA。 當(dāng)然還有一種策略是用siRNA敲低，對(duì)照組轉(zhuǎn)一個(gè)不能針對(duì)任何基因的對(duì)照siRNA。這樣就保證了三組都用同一個(gè)細(xì)胞系。 |
4樓2021-02-02 10:19:21
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2樓2021-01-31 22:43:49
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3樓2021-02-02 10:02:03
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5樓2021-02-02 14:14:22
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