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光照下閉環(huán)到開環(huán)的反應(yīng)，怎么正確地找到單重激發(fā)態(tài)的過渡態(tài)？
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做閉環(huán)到開環(huán)反應(yīng)，已經(jīng)優(yōu)化得到開環(huán)的激發(fā)單重態(tài)結(jié)構(gòu)和閉環(huán)的激發(fā)單重態(tài)結(jié)構(gòu)，怎么正確地找到單重激發(fā)態(tài)的過渡態(tài)？ 閉環(huán)結(jié)構(gòu)如下： 開環(huán)結(jié)構(gòu)如下： 優(yōu)化得到的開環(huán)激發(fā)單重態(tài)和閉環(huán)的激發(fā)單重態(tài)結(jié)構(gòu)，優(yōu)化結(jié)構(gòu)我已經(jīng)導(dǎo)出來了，在附件里(open_singlet.gjf 和close_singlet.gjf)。 根據(jù)優(yōu)化結(jié)果，我找到了閉環(huán)到開環(huán)的激發(fā)過渡態(tài)，然后我用了如下命令行優(yōu)化過渡態(tài)： opt m06/6-311g(d,p) opt(ts,modredundant,noeigen) td(singlets, nstates=15, root=1,direct) nosymm 過渡態(tài)輸入文件也在附件里（ts.gjf)。 我的問題是，現(xiàn)在過渡態(tài)已經(jīng)跑了個(gè)把月了，今天想起來看下，還在跑，但看著結(jié)構(gòu)不對(duì)了，需要重來。 真誠求教下大家問題主要出在哪里： （1）命令行輸入是否有問題？ （2）輸入結(jié)構(gòu)是否有問題？ （3）該如何修改呢？ （4）怎么樣能計(jì)算的快點(diǎn)兒？ 我試過減少nstates設(shè)定值，減少到nstates=10, 高斯跑一天就說過渡態(tài)不收斂，然后就跑不下去了。 |
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paramecium86
版主 (著名寫手)
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- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
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首先，小木蟲的附件系統(tǒng)好像最近出了問題。以前帖子中的附件都是看不到，新發(fā)的帖子根本也都傳不上去。所以要傳文件只能發(fā)個(gè)網(wǎng)盤的鏈接分享一下了。 看你發(fā)的關(guān)鍵詞部分，基本沒有什么問題（除了你寫了兩次OPT，這個(gè)應(yīng)該是你在帖子里寫錯(cuò)了要不然實(shí)際這樣的關(guān)鍵詞一開始就會(huì)出錯(cuò)的）。應(yīng)該不是關(guān)鍵詞本身的問題，而是你的這個(gè)過渡態(tài)設(shè)計(jì)的初始結(jié)構(gòu)可能不太好。 這個(gè)開環(huán)過程就僅僅是直接就斷了個(gè)鍵 就開環(huán)了么？沒有什么中間步驟么? 有沒有其它文獻(xiàn)報(bào)道過類似的路徑？如果有就可以參考一下別人的路徑。 快是很難快了 TD的優(yōu)化本身就不快。最多就是把基組調(diào)整的小一些比如6-31G(d). 不過要是都已經(jīng)算了一個(gè)月了 那你最好打開目前的輸出文件看看到底優(yōu)化了幾步了。有沒有收斂的趨勢。沒有的話不如趕緊停掉如上面所說想想路徑本身是不是合理�；蛘叱跏冀Y(jié)構(gòu)還能不能給的再更好一點(diǎn)。 |
3樓2021-03-21 04:21:19
2樓2021-03-20 23:42:49
4樓2021-04-01 00:21:37
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