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yuanxliang

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[交流] vasp跑分子動(dòng)力學(xué)的時(shí)間

vasp跑分子動(dòng)力學(xué)一般要多久啊，我NSW設(shè)置的2000，POTIM設(shè)置的3，一個(gè)120原子的二維材料跑了快20天了還沒跑完，后來將NCORE改為8和12試了一下，還是很慢。

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1樓 2024-03-25 20:24:48

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清風(fēng)拂清

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yuanxliang(金幣+1): 謝謝參與

你這個(gè)確實(shí)太慢了，檢查一下內(nèi)存

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2樓2024-03-25 20:26:49

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yuanxliang

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2樓: Originally posted by 清風(fēng)拂清 at 2024-03-25 20:26:49
你這個(gè)確實(shí)太慢了，檢查一下內(nèi)存

如果內(nèi)存不夠了咋辦呢，新手不太懂內(nèi)存這個(gè)東西，顯示Available: 85.06G，不知道夠不夠，求大佬指教

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3樓2024-03-25 20:39:58

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專注做科研的

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yuanxliang(金幣+1): 謝謝參與

VASP對(duì)內(nèi)存要求比較高，一般要配置滿通道，比如現(xiàn)在用的2顆志強(qiáng)的CPU，一個(gè)CPU要配8根內(nèi)存，2個(gè)要配16根內(nèi)存，具體看下你的服務(wù)器配置是否合理以及例子是否需要調(diào)整

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10樓2024-03-29 10:13:16

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yuanxliang

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10樓: Originally posted by 專注做科研的 at 2024-03-29 10:13:16
VASP對(duì)內(nèi)存要求比較高，一般要配置滿通道，比如現(xiàn)在用的2顆志強(qiáng)的CPU，一個(gè)CPU要配8根內(nèi)存，2個(gè)要配16根內(nèi)存，具體看下你的服務(wù)器配置是否合理以及例子是否需要調(diào)整

我是在超算上算的，配置應(yīng)該不會(huì)低吧？

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12樓2024-03-29 15:19:38

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專注做科研的

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12樓: Originally posted by yuanxliang at 2024-03-29 15:19:38
我是在超算上算的，配置應(yīng)該不會(huì)低吧？...

你可以問下超算具體的配置是什么樣子的，什么CPU、內(nèi)存等，排除硬件問題，如果硬件配置合理的話，是不是例子需要調(diào)整，我們之前有位老師用VASP，就是256核算的都很慢，最后發(fā)現(xiàn)是例子問題，調(diào)整過后，計(jì)算速度飆升

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14樓2024-04-01 09:16:37

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gan129147

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yuanxliang(金幣+1): 謝謝參與

你是用幾個(gè)核心跑的，雖然只跑了2000步，但是每一步收斂沒有，NELE一般默認(rèn)60，你用的是gamma點(diǎn)嗎，有很多很多參數(shù)可以調(diào)解加快計(jì)算，一般我算這個(gè)幾小時(shí)就跑完了，如果是20000步，加上machine learning也是幾小時(shí)

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16樓2024-04-07 13:37:12

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yuanxliang

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16樓: Originally posted by gan129147 at 2024-04-07 13:37:12
你是用幾個(gè)核心跑的，雖然只跑了2000步，但是每一步收斂沒有，NELE一般默認(rèn)60，你用的是gamma點(diǎn)嗎，有很多很多參數(shù)可以調(diào)解加快計(jì)算，一般我算這個(gè)幾小時(shí)就跑完了，如果是20000步，加上machine learning也是幾小時(shí)
...

一個(gè)節(jié)點(diǎn)24個(gè)核，用的是gamma點(diǎn)，這是我的INCAR，求指教。
#Startparameter for this run
  PREC = Low
  ISTART = 0
#  ICHARG = 2
  ENCUT= 520

#Electronic relaxation
  NELM = 150
  NELMIN = 4
  NELMDL = -12
  EDIFF = 1.E-05
  ALGO  = Very Fast
  ISYM = 0

#Ionic relaxation
  EDIFFG = -0.02
  NSW = 2000
  IBRION = 0
  ISIF = 2
  POTIM = 3
  GGA = PE
#AIMD
  MDALGO = 1
  ANDERSEN_PROB = 0.5
  TEBEG = 600
  TEEND = 600
#DOS related values
  ISMEAR = 0
  SIGMA = 0.1

#Write flags
  LWAVE = F
  LCHARG = F
#LORBIT = 12
# LVHAR=T
  NCORE=12

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17樓2024-04-08 16:26:01

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wwjdwwjd4樓

2024-03-25 21:58 回復(fù)

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xiaoqiuqiu205樓

2024-03-25 22:00 回復(fù)

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2024-03-25 22:44 回復(fù)

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2024-03-29 11:18 回復(fù)

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2024-03-29 17:18 回復(fù)

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