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萬事順意北新蟲 (正式寫手)
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想問一下如何用gaussian計(jì)算溶質(zhì)的總靜電能，可以用gaussian計(jì)算嗎 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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paramecium86
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zhou2009: 金幣+10 2022-08-25 13:37:47
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溶解自由能分解成不同的組成部分可以用Dovacuum關(guān)鍵詞。比如寫成下面的關(guān)鍵詞 #p m052x/6-31g(d) SCRF=(smd,externaliteration,dovacuum) 這種寫法算出來的溶解自由能就是跟自己算兩次單點(diǎn)能（氣相和溶劑中）相減得到的溶解自由能數(shù)值是一樣的。 輸出文件重會(huì)有類似下面的部分 Self-consistent PCM results =========================== <psi(0)| H |psi(0)> (a.u.) = -569.434121 <psi(0)|H+V(0)/2|psi(0)> (a.u.) = -569.533542 <psi(0)|H+V(f)/2|psi(0)> (a.u.) = -569.539399 <psi(f)| H |psi(f)> (a.u.) = -569.431013 <psi(f)|H+V(f)/2|psi(f)> (a.u.) = -569.536292 Total free energy in solution: - with all non electrostatic terms (a.u.) = -569.526641 -------------------------------------------------------------------- (Unpolarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -62.39 (Polarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -66.06 Solute polarization (kcal/mol) = 1.95 Total electrostatic (kcal/mol) = -64.11 -------------------------------------------------------------------- SMD-CDS (non-electrostatic) energy (kcal/mol) = 6.06 Total non electrostatic (kcal/mol) = 6.06 DeltaG (solv) (kcal/mol) = -58.06 其中 Total electrostatic 就是溶解自由能中總的靜電部分的貢獻(xiàn)。 |
2樓2022-08-25 12:44:16
萬事順意北
新蟲 (正式寫手)
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3樓2022-08-26 08:33:58
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