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燈泡3204

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[求助] 晶體解析時(shí)出現(xiàn)一個(gè)Q峰，不知如何歸屬已有1人參與

如題，請(qǐng)高手指點(diǎn)一下！

晶體-1.jpg

晶體-2.jpg

刪掉Q1和C24后，兩個(gè)Q峰會(huì)再次出現(xiàn)，如下圖：

晶體-3.jpg

晶體-4.jpg

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1樓 2020-11-15 17:20:49

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mfdsrax2

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看都看不清楚，直接上數(shù)據(jù)吧

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2樓2020-11-15 20:22:54

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2樓: Originally posted by mfdsrax2 at 2020-11-15 20:22:54
看都看不清楚，直接上數(shù)據(jù)吧

非常感謝

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3樓2020-11-15 21:04:33

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Space group P 21/n P 21/n
Hall group -P 2yn -P 2yn
Moiety formula C24 H29 N4 O3 ?
Sum formula C24 H29 N4 O3 C24 H29 N4 O3
Mr 421.51 421.51
Dx,g cm-3 1.331 1.331
Z 4 4
Mu (mm-1) 0.089 0.089
F000 900.0 900.0
F000’ 900.37
h,k,lmax 8,25,16 8,25,16
Nref 3700 3698
Tmin,Tmax 0.979,0.991
Tmin’ 0.974
Correction method= Not given
Data completeness= 0.999 Theta(max)= 25.000
R(reflections)= 0.0676( 2658) wR2(reflections)= 0.2228( 3698)
S = 1.056 Npar= 312
The following ALERTS were generated. Each ALERT has the format
test-name_ALERT_alert-type_alert-level.
Click on the hyperlinks for more details of the test.
Alert level C
PLAT052_ALERT_1_C Info on Absorption Correction Method Not Given Please Do !
PLAT222_ALERT_3_C NonSolvent Resd 1 H Uiso(max)/Uiso(min) Range 7.1 Ratio
PLAT230_ALERT_2_C Hirshfeld Test Diff for O1 --C6 . 6.7 s.u.
PLAT242_ALERT_2_C Low ’MainMol’ Ueq as Compared to Neighbors of C23 Check
PLAT340_ALERT_3_C Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.00462 Ang.
PLAT906_ALERT_3_C Large K Value in the Analysis of Variance ...... 2.196 Check
PLAT911_ALERT_3_C Missing FCF Refl Between Thmin & STh/L= 0.595 2 Report
PLAT976_ALERT_2_C Check Calcd Resid. Dens. 0.45A From O3’ -0.48 eA-3
PLAT977_ALERT_2_C Check Negative Difference Density on H23’ -0.36 eA-3

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燈泡3204

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4樓2020-11-16 12:42:52

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4樓: Originally posted by 羊倌 at 2020-11-16 12:42:52
Space group P 21/n P 21/n
Hall group -P 2yn -P 2yn
Moiety formula C24 H29 N4 O3 ?
Sum formula C24 H29 N4 O3 C24 H29 N4 O3
Mr 421.51 421.51
Dx,g cm-3 1.331 1.331
Z 4 4
Mu (mm-1) 0.089 0.089
F0 ...

抱歉我沒看明白，目前我pick了25個(gè)碳，還有一個(gè)非氫Q峰，您是指我一個(gè)原子指認(rèn)錯(cuò)誤？麻煩您詳細(xì)指點(diǎn)我一下？

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5樓2020-11-16 14:07:36

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5樓: Originally posted by 燈泡3204 at 2020-11-16 14:07:36
抱歉我沒看明白，目前我pick了25個(gè)碳，還有一個(gè)非氫Q峰，您是指我一個(gè)原子指認(rèn)錯(cuò)誤？麻煩您詳細(xì)指點(diǎn)我一下？

...

修成氧

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6樓2020-11-16 18:29:50

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7樓2020-11-16 18:30:29

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7樓: Originally posted by 羊倌 at 2020-11-16 18:30:29
修成氧

是將左下角的非氫Q1修成氧，還是C25修成氧，感覺鍵長(zhǎng)不對(duì)啊，麻煩你了，我想不明白了！Q1和C23鍵長(zhǎng)1.184左右，C25，C23鍵長(zhǎng)1.413，我把C25修成氧之后，Q1還是會(huì)出現(xiàn)，Q1修成氧，鍵長(zhǎng)不對(duì)啊！我有點(diǎn)糊涂了！還請(qǐng)多多指點(diǎn)！非常感謝！

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8樓2020-11-16 19:23:58

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8樓: Originally posted by 燈泡3204 at 2020-11-16 19:23:58
是將左下角的非氫Q1修成氧，還是C25修成氧，感覺鍵長(zhǎng)不對(duì)啊，麻煩你了，我想不明白了！Q1和C23鍵長(zhǎng)1.184左右，C25，C23鍵長(zhǎng)1.413，我把C25修成氧之后，Q1還是會(huì)出現(xiàn)，Q1修成氧，鍵長(zhǎng)不對(duì)��！我有點(diǎn)糊涂了！還請(qǐng)多多 ...

看不清楚，這都什么年代了，你還用這種軟件。

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9樓2020-11-16 19:54:42

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9樓: Originally posted by 羊倌 at 2020-11-16 19:54:42
看不清楚，這都什么年代了，你還用這種軟件。...

還有Olex2，我一般用Olex2看一下結(jié)構(gòu)，然后還是用shelxtl來精修，Olex2精修部分還沒搞明白，只會(huì)反復(fù)點(diǎn)Refine，我不知道怎么處理這個(gè)非氫Q峰，修成氧感覺鍵長(zhǎng)不對(duì)，C-O鍵沒有這么短的

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10樓2020-11-16 20:05:27

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