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bigenid

木蟲 (著名寫手)

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[交流] 求解：評(píng)審專家提出KEGG顯著富集通路上的6個(gè)基因，但在GO富集中不顯著？咋解釋？

求解：評(píng)審專家提出KEGG顯著富集通路上的基因，在GO富集中不顯著？咋解釋？

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1樓 2023-09-23 09:10:40

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lisaru

銀蟲 (正式寫手)

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★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

這審稿專家也是一知半解，KEGG和GO是不同的富集方式，結(jié)果當(dāng)然可能不同。富集顯著性與所在通路基因數(shù)目有關(guān)，KEGG和GO本來(lái)就是不同的分類方式，怎么好拿來(lái)橫向比較？

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10樓2023-09-26 10:50:21

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micro_lsp

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★
bigenid(金幣+1): 謝謝參與

兩種富集就不是一回事，有差異也是正常的。

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6樓2023-09-23 10:38:41

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走了002

新蟲 (著名寫手)

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★
bigenid(金幣+1): 謝謝參與

主要看kegg通路，go沒(méi)啥意義，常規(guī)分析即可

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bigenid

7樓2023-09-23 12:46:27

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bigenid

木蟲 (著名寫手)

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引用回帖:

6樓: Originally posted by micro_lsp at 2023-09-23 10:38:41
兩種富集就不是一回事，有差異也是正常的。

KEGG和GO哪個(gè)更重要一些呢？

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8樓2023-09-23 17:13:54

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簡(jiǎn)單回復(fù)

zusn3樓

2023-09-23 09:25 回復(fù)

bigenid(金幣+1): 謝謝參與

引用回帖:

2樓: Originally posted by bigenid at 2023-09-23 09:20:36

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沒(méi)有感覺(jué)的魚4樓

2023-09-23 09:44 回復(fù)

bigenid(金幣+1): 謝謝參與

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水可南陽(yáng)5樓

2023-09-23 10:21 回復(fù)

bigenid(金幣+1): 謝謝參與

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